Nesta localidade, à época do descobrimento (1549), foi construído um aldeamento que serviu à catequese indígena (tupi-guaranis e tapuias).

Esse aldeamento era um ponto de parada dos jesuítas que partiam de São Vicente em direção ao sul.

A igreja original com aproximadamente 50 metros quadrados tinha as janelas em forma de seteiras (janelas com bases afuniladas que permitiam boa visibilidade para quem estava do lado de dentro) que indicavam que o local era alvo de ataques de índios que habitavam a região.

A palavra "abarebebê" significa "padre voador" apelido dado pelos indígenas ao Padre Leonardo Nunes, missionário jesuíta que  chegou a região de Peruíbe em 1549. Na sua função de missionário o padre viajava muito dando aos índios a impressão de estar em vários locais ao mesmo tempo, daí resultando seu apelido.